Пикорнавирусы

Материал из Википедии — свободной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
Пикорнавирусы
Вирус полиомиелита
Вирус полиомиелита
Научная классификация
Группа:
Реалм:
Царство:
Класс:
Порядок:
Семейство:
Пикорнавирусы
Международное научное название
Picornaviridae
Роды
см. текст
Группа по Балтимору
IV: (+)оцРНК-вирусы

Пикорнави́русы[2] (лат. Picornaviridae, от pico — маленький и rna — РНК) — семейство, объединяющее маленькие икосаэдрические вирусы высших позвоночных, содержащих одноцепочечную геномную РНК положительной полярности (то есть той же полярности, что и мРНК). Размер капсида составляет около 27—30 нм, размер генома — около 7—8 тысяч оснований. Размножение пикорнавирусов происходит в цитоплазме заражённой клетки. К пикорнавирусам относятся возбудители таких заболеваний, как полиомиелит, ринит, ящур, гепатит A и др. В мире вирусов пикорнавирусы выделяются очень высокой скоростью мутирования, что обуславливает высокую вероятность появления вредоносных для человека их вариантов[3].

Строение генома

[править | править код]
Общая схема строения геномной РНК (A) и процессинга полипротеина пикорнавирусов (B)

Геномная РНК пикорнавирусов содержит в большинстве случаев одну открытую рамку считывания под контролем IRES — участка внутренней посадки рибосомы. Трансляция вирусной РНК приводит к образованию гигантского белка-предшественника, который ещё до завершения синтеза нарезается вирусными протеазами, с образованием зрелых вирусных белков. К 5'-концу вирусной РНК ковалентно прикреплён маленький белок — VPg (от англ. viral protein genome linked, вирусный белок, соединённый с геномом). 3'-конец полиаденилирован (содержит несколько десятков остатков аденина, подобно клеточным мРНК). На 5'- и 3'-концах вирусной РНК располагаются так называемые цис-репликативные элементы (OriL и OriR, соответственно — от англ. origin — «начало», left — «левый», right — «правый») — последовательности, необходимые для репликации генома.

Белки пикорнавирусов

[править | править код]

Геном пикорнавирусов кодирует около десятка белков, обеспечивающих репликацию вирусной РНК, перепрограммирование клетки, сборку зрелых вирионов. Кодирующую область генома довольно условно делят на три участка: P1 — кодирует структурные белки VP1, VP2, VP3, VP4, из которых строится вирусная частица. P2 и P3 — кодируют белки, необходимые для перепрограммирования клетки и репликации:

  • 2А — негомологичен у представителей разных родов пикорнавирусов. Например, у афто- и кардиовирусов — это пептид, который вызывает ко-трансляционный разрыв в синтезируемой белковой цепи полипротеина, а у энтеро- и риновирусов — сериновая протеаза.
  • 2B и 3A — небольшие гидрофобные белки, принимающие участие в вызываемом пикорнавирусами изменении мембран клетки.
  • 2С — этот белок имеет гомологию с хеликазами, входит в состав пикорнавирусного репликативного комплекса.
  • 3B — это VPg, белок прикрепляющийся к 5'-концу вирусной РНК.
  • 3С — цистеиновая протеаза, разрезающая полипротеин[4].
  • 3D — РНК-полимераза, белок синтезирующий вирусную РНК.
  • L — лидерный белок также негомологичен у представителей разных родов, у ряда пикорнавирусов отсутствует. У афтовирусов он является протеазой, отщепляющей себя от полипротеина, у кардиовирусов[англ.] и Teschovirus[англ.] лишён энзиматической активности.

Классификация

[править | править код]

По данным Международного комитета по таксономии вирусов (ICTV), на май 2024 г. в семейство включают 68 родов[5]:

Род Вид (представитель)
Ailurivirus Ailurivirus agiapa
Aphthovirus Aphthovirus reedi
Bopivirus Bopivirus abovi
Cardiovirus Cardiovirus saffoldi
Cosavirus Cosavirus depakis
Erbovirus Erbovirus aequirhi
Hunnivirus Hunnivirus amagyari
Malagasivirus Malagasivirus alphalesa
Marsupivirus Marsupivirus aburpengari
Mischivirus Mischivirus acombewi
Mosavirus Mosavirus betibeti
Mupivirus Mupivirus arati
Senecavirus Senecavirus cetus
Teschovirus Teschovirus asilesi
Torchivirus Torchivirus atorpi
Tottorivirus Tottorivirus asuscro
Anativirus Anativirus aductai
Boosepivirus Boosepivirus atauri
Diresapivirus Diresapivirus arhiferi
Enterovirus Enterovirus deconjuncti
Felipivirus Felipivirus acati
Parabovirus Parabovirus chiwhibe
Rabovirus Rabovirus dehomo
Sapelovirus Sapelovirus anglia
Caecilivirus Caecilivirus banna
Crahelivirus Crahelivirus agapo
Fipivirus Fipivirus besharpi
Gruhelivirus Gruhelivirus agrusa
Hepatovirus Hepatovirus ishrewi
Rohelivirus Rohelivirus arodenti
Tremovirus Tremovirus beturtli
Danipivirus Danipivirus abrafi
Dicipivirus Dicipivirus acadici
Gallivirus Gallivirus afowli
Hemipivirus Hemipivirus aholtge
Kobuvirus Kobuvirus aichi
Livupivirus Livupivirus asmonewi
Ludopivirus Ludopivirus agrewhifrogo
Megrivirus Megrivirus chigalli
Myrropivirus Myrropivirus achiwas
Oscivirus Oscivirus ahokorobi
Passerivirus Passerivirus bewaxi
Pemapivirus Pemapivirus brohepotu
Poecivirus Poecivirus ablacachi
Pygoscepivirus Pygoscepivirus apingu
Rafivirus Rafivirus crhima
Rajidapivirus Rajidapivirus ashaska
Rosavirus Rosavirus chewhibe
Sakobuvirus Sakobuvirus aportufeli
Salivirus Salivirus aklasse
Sicinivirus Sicinivirus ahiberni
Symapivirus Symapivirus atriliza
Tropivirus Tropivirus betero
Aalivirus Aalivirus apekidu
Aquamavirus Aquamavirus apinni
Avihepatovirus Avihepatovirus ahepati
Avisivirus Avisivirus aturki
Crohivirus Crohivirus beidoli
Grusopivirus Grusopivirus celori
Kunsagivirus Kunsagivirus agrepla
Limnipivirus Limnipivirus disploca
Orivirus Orivirus aoroshaza
Parechovirus Parechovirus feterobo
Pasivirus Pasivirus agallia
Potamipivirus Potamipivirus balaski
Shanbavirus Shanbavirus aminfuli
Ampivirus Ampivirus apilisi
Harkavirus Harkavirus alfoldi

Примечания

[править | править код]
  1. Таксономия вирусов (англ.) на сайте Международного комитета по таксономии вирусов (ICTV).
  2. Атлас по медицинской микробиологии, вирусологии и иммунологии : Учебное пособие для студентов медицинских вузов / Под ред. А. А. Воробьева, А. С. Быкова. — М. : Медицинское информационное агентство, 2003. — С. 117. — ISBN 5-89481-136-8.
  3. С. Дмитриев. Вирус — это хакер, взламывающий программу клетки // Наука и жизнь. — 2022. — № 5. — С. 8.
  4. Malcolm B. A. The picornaviral 3C proteinases: cysteine nucleophiles in serine proteinase folds. : [англ.] // Protein Sci. — 1995. — Vol. 4, no. 8 (August). — P. 1439—1445.
  5. Таксономия вирусов (англ.) на сайте Международного комитета по таксономии вирусов (ICTV)(Дата обращения: 24 мая 2024).

Литература

[править | править код]
  • Сергеев В. А., Непоклонов Е. А., Алипер Т. И. 10.23 Пикорнавирусы // Вирусы и вирусные вакцины. — М. : Библионика, 2007. — С. 448—462. — ISBN 5-98685-012-2.
  • Semler B. L., and Wimmer E. 2002. Molecular Biology of Picornaviruses. American Society for Microbiology, Washington, D.C.